FDR thresh PSMs trn PSMs tst 0 7975 2329 0.0012 8490 2329 0.0025 9488 2691 0.0037 9916 2798 0.005 10049 3010 0.0062 10111 3033 0.0075 10413 3283 0.0087 10616 3298 0.01 10651 3320 0.015 10893 3459 0.02 11116 3431 0.025 11221 3577 0.03 11425 3594 0.035 11520 3700 0.04 11637 3696 0.045 11779 3719 0.05 11870 3734 0.055 11941 3767 0.06 12021 3798 0.065 12071 3817 0.07 12172 3876 0.075 12207 3900 0.08 12290 3912 0.085 12324 3927 0.09 12405 3964 0.095 12431 3975 0.1 12482 3967 0.105 12518 3974