FDR thresh PSMs trn PSMs tst 0 8234 2766 0.0012 8385 2766 0.0025 9053 2943 0.0037 9119 3010 0.005 9321 2814 0.0062 9523 3047 0.0075 9625 3078 0.0087 9665 3206 0.01 9786 3232 0.015 9898 3306 0.02 9999 3322 0.025 10029 3338 0.03 10156 3369 0.035 10188 3393 0.04 10239 3397 0.045 10256 3406 0.05 10275 3428 0.055 10313 3443 0.06 10386 3448 0.065 10412 3455 0.07 10425 3468 0.075 10445 3472 0.08 10451 3480 0.085 10465 3483 0.09 10487 3488 0.095 10493 3491 0.1 10518 3501 0.105 10532 3516